经营所得和个人工资薪金所得在个人所得税上的税率结构是不同的。经营所得适用的是百分之五至百分之三十五的超额累进税率，这个税率表是针对个体工商户、个人独资企业投资人、合伙企业的个人合伙人的经营收入，包括从合伙企业领取的工资。而工资薪金所得则属于综合所得的一部分，同样适用的是百分之三至百分之四十五的超额累进税率，但这是针对雇员从雇主那里获得的工资、薪金等劳动报酬。

经营所得的税率通常与企业的盈利水平直接相关，而工资薪金所得的税率则与个人的全部工资收入有关，且在计算时可以享受一些专项扣除和专项附加扣除。此外，经营所得在计算个税时，可能会涉及到成本、费用的扣除，而工资薪金所得通常不涉及这些扣除。