合同履约成本为负数，该项目于2021年12月挂应付账款90万元，于2022年1月份分别付款30.92万元和79.23万元，其中79.23万元未冲销应付账款余额应付余额59.08万元（90-30.92），重复计入合同履约成本，由于系统限制，必须先调整为合同履约成本负数，再进行冲销，拟9月份进行账务处理，账务处理怎么做
根据您提供的信息，合同履约成本出现了负数，这意味着实际发生的成本低于预期的合同履约成本，形成了一个负的合同履约成本余额。在9月份进行账务调整时，可以按照以下步骤进行：
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首先，需要调整合同履约成本的负数余额，将90万元的应付账款调整为合同履约成本负数余额： 借：合同履约成本（负数，-59.08万元） 贷：应付账款——XX供应商（59.08万元）
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接下来，冲销应付账款余额，确保账务平衡： 借：应付账款——XX供应商（59.08万元） 贷：银行存款/库存现金（59.08万元）
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最后，调整合同履约成本的负数余额，将之前误计入的79.23万元从合同履约成本中转出： 借：银行存款/库存现金（79.23万元） 贷：合同履约成本（79.23万元）
请注意，实际的账务处理应根据会计准则和贵公司的具体情况来确定，包括内部控制系统和流程。上述处理是基于提供的数据和假设，如果贵公司有特定的会计政策或流程，应根据这些政策和流程进行调整。同时，如果9月份进行账务处理时，需要确保所有的调整符合会计期间的一致性原则，避免对财务报表的可比性产生影响。
