根据会计准则，预付的设备预付款项通常反映了企业对将来要交付的设备的权利，如果这笔预付款已经入账到在建工程，但后来发现这笔预付款对应的是长期性质的设备，比如定制设备或大型设备，那么根据会计原则，这笔预付款项应重分类到非流动资产项下，以反映其非流动的性质。这种调整可以通过以下步骤进行：

1. 首先，需要冲销原记入“在建工程”的预付款项，借记“在建工程——在安装设备”（或其他相关明细科目），贷记“资产基金——在建工程”和“资本性支出”科目，以减少在建工程中的相应金额。
2. 然后，借记“其他非流动资产”科目，贷记“在建工程——在安装设备”科目，将预付款项从在建工程转出，反映其长期投资的性质。

这个调整体现了预付款项的实质，即企业对一项非流动资产的权利，而非短期的建设活动。重要的是，企业需要在财务报表附注中充分披露这一调整的原因和过程，以便于财务报表使用者理解这项会计处理的依据。