在合并财务报表中，如果子公司当期亏损超过了少数股东在该子公司期初所有者权益中所享有的份额，其余额应冲减少数股东权益。具体会计分录如下：

1. 如果子公司亏损，少数股东应分担的亏损超过了他们在期初所有者权益中的份额，那么超出部分应冲减少数股东权益。会计分录如下：

借：少数股东权益  （金额）
贷：少数股东权益 - 超额亏损

1. 如果子公司盈利，那么在合并利润表中，子公司当期净损益中属于少数股东权益的份额，会计分录如下：

借：少数股东损益  （金额）
贷：投资收益 - 少数股东应分担的盈利

请注意，这里的会计分录是基于假设的，实际的会计处理需要根据实际的亏损或盈利金额来确定。在实际操作中，需要根据子公司实际的财务数据来计算具体的金额。