根据企业会计准则，当企业从银行开具银行承兑汇票并支付了40%的保证金后，这部分保证金应该作为一项负债进行记录，因为它代表了企业的一项未来经济利益流出。在承兑汇票到期后，银行会收取剩余60%的金额，此时企业需要将此预期的未来支付体现在财务报表中。因此，当开具承兑汇票并支付保证金时，企业应做如下账务处理：

1. 企业支付40%保证金时，借方记账科目可能包括“其他应付款——保证金”，贷方则对应“银行存款”，表示企业向银行支付了一笔保证金。

2. 随着承兑汇票的到期，银行要求支付剩余的60%金额时，企业需要将此未来的支付义务体现在财务报表中，这通常会记入“一年内到期的非流动负债”科目，表示企业有在未来需要向银行支付的义务。

3. 当实际支付这笔款项给银行时，借方科目可能是“一年内到期的非流动负债”，贷方科目则为“银行存款”。

请注意，保证金的会计处理需根据实际情况和合同条款，结合企业会计准则进行具体分析和判断。