根据企业会计准则第20号-企业合并条款规定，在应用成本法进行合并会计处理时，主要目的是消除合并财务报表中的内部交易影响。在母公司以成本法计量对子公司的长期股权投资时，应当对以下几个方面进行抵销：

1. 抵销内部应收应付：根据条款规定，母公司与子公司之间的应收应付账款、应收应付票据等内部债权债务在编制合并财务报表时应互相抵销。

2. 抵销内部交易利润：企业合并后，母公司与子公司之间、子公司相互之间的商品销售、服务提供等交易中的未实现利润要互相抵销。

3. 抵销内部投资收益：如果母公司在子公司中的投资以成本法入账，那么在编制合并报表时需要抵销子公司支付给母公司的股利收益，同时母公司确认的投资收益也应当抵销。

4. 抵销其他相关会计科目：上述抵销过程还可能涉及其他会计科目的调整，如递延所得税资产或负债等，这取决于具体的抵销事项和影响。

在列编制合并财务报表的工作底稿时，应根据每项内部交易的具体情况，制定相应的会计分录，确保合并财务报表能客观公正地反映合并企业集团的财务状况和经营成果。