从内部控制的角度来看，集团财务总监同时担任控股子公司的总经理可能会导致以下风险：

1. 决策集中风险：一人同时担任这两个角色可能导致决策过于集中，缺乏有效的制衡，增加错误决策的风险。

2. 利益冲突：财务总监可能在平衡集团和子公司利益时面临冲突，可能导致资源分配不公或损害集团的整体利益。

3. 信息隔离：财务信息和运营信息的融合可能阻碍内部信息的有效隔离，影响决策的独立性和公正性。

4. 审计独立性：内部审计可能受到影响，因为财务总监作为高级管理层的一员，可能对审计结果产生不当影响。

5. 合规风险：在处理关联交易、信息披露等方面，可能存在违规操作的风险，因为决策者可能倾向于掩盖不利信息。

举例来说，假设上市公司A的财务总监同时也是其重要子公司的总经理。如果子公司在财务报告中隐瞒亏损，而财务总监未能有效地履行监督职责，这可能导致集团的财务报表不准确，违反了证券法规，可能会引发监管机构的调查和股东的诉讼。此外，如果子公司在没有适当审批的情况下进行大额投资，由于财务总监同时负责决策，可能会导致集团资本配置的不合理，增加财务风险。

因此，尽管法律可能允许这种安排，但为了维护良好的公司治理和内部控制，通常建议职务分离，以确保决策的透明度和有效性。