根据企业会计准则第18号-收入条款，企业应当在交易或事项发生过程中，根据收入的实际成就情况确认收入。同时，根据税法的相关规定，增值税的纳税义务发生时间一般是在交付货物、提供劳务、发生服务等情形，或者发票开具的时间，取先发生的一方。而企业所得税的纳税义务一般是在收入确认的时点发生。

因此，对于已经完工的工程项目，如果按照合同规定和企业会计政策，收入已经可以确认，那么企业需要在确认收入的时间点计入销项税额，并在企业所得税方面，应按规定确认收入并计算应纳税所得额，从而缴纳相应的企业所得税。

如果开具发票或收款的时间早于收入确认的时间，则应按照实际发生的最早时间点计算并缴纳增值税。如果发票开具和收款时间晚于收入确认的时间，企业应根据有关税法规定的条款计算并缴纳增值税。另外，企业发生实际成本支出且有相关证据的，也可能需要计提增值税进项税额。

具体操作时，请遵守国家税务总局等主管税务机关的相关规定，因不同地区和情形可能有不同的规定。所以在实际操作中，建议咨询当地的税务专业人员或税务机关，以便得到更准确的指导。