当企业使用银行存款回购库存股时，会计处理如下：

1. 回购库存股时： 借：库存股（实际支付的金额） 贷：银行存款（实际支付的金额）

2. 若后期注销库存股： 借：股本（股票面值） 资本公积——股本溢价（超出股本部分，如有） 盈余公积/利润分配——未分配利润（如有需要） 贷：库存股（回购时的金额）

这个处理遵循了企业会计准则第37号-金融工具列报（2017）的规定，回购自身权益工具支付的对价和交易费用应当减少所有者权益，不得确认为金融资产。库存股的注销会相应减少股本和其他所有者权益项目。