在处理收入确认依据不规范或不完整的情况时，财务部门应采取以下措施：

1. 完善收入确认政策：确保遵循《企业会计准则第14号——收入》的规定，明确收入确认的标准和时点。

2. 强化合同管理：对所有销售合同进行审查，确保合同条款清晰，收入确认条件明确。

3. 加强内部控制系统：建立严格的收入确认流程，包括审批、核对和文档记录，以减少人为错误和潜在的操纵。

4. 细化收入分类：对于不同类型的收入，如预收款项、服务收入、商品销售收入等，应分别进行记录和跟踪，确保准确无误。

5. 定期进行收入截止测试：检查收入是否在正确的会计期间内记录，防止收入跨期。

6. 加强与审计部门的沟通：及时解决审计中发现的问题，提供充分的收入确认依据，如销售合同、发货单、验收报告等。

7. 完善信息披露：在财务报告中充分披露收入确认的依据和方法，提高透明度。

通过这些措施，企业可以提高收入确认的合规性和准确性，降低财务风险。