根据企业会计准则第1号—存货（2006）-第二章 确认-第四条，存货同时满足下列条件的，才能予以确认：（一）与该存货有关的经济利益很可能流入企业；（二）该存货的成本能够可靠地计量。

在本案中，A注册会计师于2020年末检查了相关的开户证实书原件，于2021年2月检查了到期兑付的银行凭证及相关的银行对账单，据此认可了该笔定期存款的存在。这一做法是恰当的，因为注册会计师需要确保存货的存在和状况，以确认存货的准确性和完整性。

因此，注册会计师应当重新评估审计程序，确保对存货的审计程序充分、适当，并能够获取充分、适当的审计证据。注册会计师应当考虑实施其他审计程序，如存货的实物检查、存货的估值测试、存货的盘点程序等，以确保存货的准确性。如果注册会计师无法获取充分、适当的审计证据，应当考虑这一情况对审计意见的影响。